Bioinformatics
Bioinformatics

- Essenzielle biologische Grundlagen: Aufbau von Organismen, Zellen, Biomoleküle (DNA, RNA, Proteine)
- Datenintensive Probleme der Biologie und Biomedizin
- Analytische Methoden der Biologie und deren Output (Sequenzen, Strukturen, etc.)
- Organisation der Daten: Biologische Datenbanken
- Methoden zur Verarbeitung biologischer Daten, insbes. Methoden zur Sequenzanalyse (Alignment, Multiples Alignment, Mustersuche, Phylogenie, Hidden Markov Models etc.), Methoden zur Strukturvorhersage und zum Biomolecular Modelling, Methoden zur Analyse biologischer Netze

- Kenntnis biologischer Grundlagen
- Kenntnis wichtiger, datenintensiver biologischer Probleme
- Kenntnis von bioinformatischen Verfahren zur Lösung solcher Probleme
- Fähigkeit solche Verfahren einsetzen oder entwickeln zu können
- Fähigkeit Resultate der Anwendung solcher Verfahren kritisch interpretieren zu können

(1) Vorlesungsskript, (2) Zvelebil and Baum, Understanding Bioinformatics, Garland 2008

All parts of the module are in English.

- Biology basics: organisms, cells, biomolecules (DNA, RNA, proteins)
- Data intensive problems of biology and biomedicine
- Analytical methods in biology and their output (sequences, structures, etc.)
- Organization of data: biological databases
- Methods for the processing of biological data, esp. methods for sequence analysis (alignments, multiple alignment, pattern
search, phylogeny, hidden Markov models, etc.), methods for molecular structure prediction, biological networks

- Knowledge of biological basics
- Knowledge of data intensive biological problems
- Knowledge of computational methods that solve such problems
- Ability to use or develop such methods
- Ability to critically judge the output of such methods

(1) Vorlesungsskript, (2) Zvelebil and Baum, Understanding Bioinformatics, Garland 2008

All parts of the module are in English.