MERLIN sucht nach neuen, weithin anwendbaren Lösungen für die Wiederherstellung der Funktionen von Süßwasser-Ökosystemen, um etwa den Hochwasserrückhalt zu verbessern und Kohlendioxid zu speichern.

RESIST untersucht, wie Gewässer und ihre Lebensräume auf die vielen Belastungen reagieren. Gefördert von der Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) mit 12,3 Millionen Euro.

Praxistest der biozönotischen Auenzustandsbewertung als Grundlage für die Bewertung von Renaturierungsmaßnahmen (BioAu-Praxistest)

Bereitstellung von Online-Berechnungstools zur Ermittlung der ökologischen Qualität von Gewässern  im Auftrag des Umweltbundesamts.

Im Zuge einer Zusammenarbeit mit der ABU Soest untersuchte die Abteilung Aquatische Ökologie das Makrozoobenthos von Bächen im Arnsberger Wald.