DFG-Förderung für innovative Forschungsinfrastruktur
Neue Datenanalyseplattform „SRPtn“
- von Marie-Christine Sassenberg
- 24.02.2026
Die Medizinische Fakultät der Universität Duisburg-Essen freut sich über eine Förderung der Deutschen Forschungsgemeinschaft für Prof. Dr. Johannes Köster und Prof. Dr. Daniel R. Engel. Sie entwickeln mit „SRPtn“ (Serpentine) eine Datenanalyseplattform auf Basis des international etablierten Workflow-Systems „Snakemake“. Die Plattform vernetzt Teams, führt Analysen von Rohdaten bis zur fertigen Publikation durch und sichert Transparenz sowie Reproduzierbarkeit. Die DFG unterstützt das Projekt mit mehr als 600.000 Euro über einen Zeitraum von 36 Monaten.
Prof. Dr. Köster ist Professor für Bioinformatische Algorithmen in der Onkologie am Institut für Künstliche Intelligenz in der Medizin (IKIM), Prof. Dr. Engel arbeitet als Professor für Immundynamik am Institut für Experimentelle Immunologie. Im Rahmen ihres Projekts „SRPtn: Solving the Last Mile Problem of In Silico Reproducibility“ entwickeln sie gemeinsam mit Dr. Henning Timm von den Research Data Services der Universität Duisburg-Essen die integrierte Datenanalyseplattform „SRPtn“.
Sie basiert auf dem von Köster entwickelten Workflow-Management-System „Snakemake“. Die Plattform soll Forschenden unterschiedlicher Disziplinen ermöglichen, komplexe Datenanalysen kollaborativ und durchgängig durchzuführen – von den Rohdaten bis zu den finalen Abbildungen und Tabellen einer wissenschaftlichen Publikation. Dabei sollen zugleich Transparenz und Reproduzierbarkeit sichergestellt werden. Dazu finden unterschiedliche, oft komplementäre Kompetenzen innerhalb eines Teams Berücksichtigung. KI-Funktionen unterstützen diese.
Hier geht es zur ausführlichen Pressemeldung.
Im Bild (v.l.): Prof. Dr. Daniel R. Engel und Prof. Dr. Johannes Köster